Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIPSLA2A3N6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms