Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMED7Q9Y3B3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms