Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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USP18Q9UMW8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP18Q9UMW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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