Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms