Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTNNA3Q9UI47 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTNNA3Q9UI47 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms