Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFDP1Q9UEE9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFDP1Q9UEE9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.9 ms