Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms