Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPARGC1AQ9UBK2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PPARGC1AQ9UBK2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms