Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C6orf48Q9UBA6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms