Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REREQ9P2R6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REREQ9P2R6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REREQ9P2R6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REREQ9P2R6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
REREQ9P2R6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
REREQ9P2R6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REREQ9P2R6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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