Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms