Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms