Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HIGD1BQ9P298 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms