Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms