Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RDH8Q9NYR8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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