Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms