Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GIN1Q9NXP7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms