Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TBCCD1Q9NVR7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms