Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CMTM1-218ENST00000533915 899 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 09e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CMTM1-212ENST00000529386 924 ntTSL 1 (best)15.06■□□□□ 09e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FRAT1-202ENST00000490980 633 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJC11-209ENST00000472414 725 ntTSL 315.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SERGEF-216ENST00000531299 440 ntTSL 214.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MUS81-205ENST00000525224 285 ntTSL 514.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FCHO1-214ENST00000596507 1014 ntTSL 514.97□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FCHO1-222ENST00000597718 884 ntTSL 514.97□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HS1BP3-207ENST00000458740 518 ntTSL 214.97□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPP9-211ENST00000597900 728 ntTSL 314.95□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AP5Z1-203ENST00000477454 576 ntTSL 414.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MLLT1-203ENST00000587473 556 ntTSL 214.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-205ENST00000561959 558 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CYTH3-204ENST00000465320 576 ntTSL 414.87□□□□□ -0.039e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJB12-206ENST00000473051 717 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.039e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-208ENST00000432893 1014 ntTSL 514.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ANAPC5-220ENST00000544442 915 ntTSL 514.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PPP4R3A-207ENST00000555029 571 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-209ENST00000476897 551 ntTSL 414.8□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FANCD2-206ENST00000435522 567 ntTSL 414.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RUFY1-209ENST00000503583 854 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IL20RB-205ENST00000491483 956 ntTSL 514.76□□□□□ -0.059e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-217ENST00000577897 536 ntTSL 414.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BZW2-210ENST00000438834 674 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HYKK-204ENST00000566289 2180 ntTSL 214.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-211ENST00000512410 666 ntTSL 214.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AMPD3-218ENST00000534047 2376 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AFG1L-203ENST00000430458 542 ntTSL 514.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.079e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.089e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FPGS-214ENST00000479375 690 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MIATNB-209ENST00000450963 658 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SIGIRR-215ENST00000528698 733 ntTSL 514.53□□□□□ -0.082e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VPS33A-208ENST00000543633 2019 ntTSL 514.52□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CAMTA2-207ENST00000572326 437 ntTSL 314.5□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-207ENST00000474033 1171 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-208ENST00000547813 1024 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.099e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WDR90-207ENST00000547407 3847 ntTSL 214.46□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SSSCA1-204ENST00000527413 532 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VPS18-203ENST00000558855 1050 ntTSL 514.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-208ENST00000529547 545 ntTSL 414.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RNF144A-206ENST00000471060 584 ntTSL 514.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-204ENST00000416880 527 ntTSL 414.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-210ENST00000490363 4065 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-213ENST00000471156 764 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 214.39□□□□□ -0.114e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GNA12-204ENST00000447791 559 ntTSL 414.38□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADA-208ENST00000539235 812 ntTSL 514.37□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.114e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMG9-212ENST00000601925 550 ntTSL 414.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS3-229ENST00000496275 599 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.129e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NBAS-206ENST00000433283 687 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SIGIRR-205ENST00000525299 749 ntTSL 514.32□□□□□ -0.122e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.134e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMGN1-211ENST00000471260 615 ntTSL 314.24□□□□□ -0.134e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC096887.1-202ENST00000607283 690 ntAPPRIS P5 TSL 514.22□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MAP2K7-207ENST00000494348 724 ntTSL 514.22□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.149e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NEIL1-213ENST00000567393 1221 ntTSL 514.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-215ENST00000550557 4837 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.149e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RBM18-202ENST00000483428 889 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 149.1
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