Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRHQ9HD43 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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