Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms