Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms