Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
RNF17Q9BXT8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF17Q9BXT8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms