Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BBS2Q9BXC9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms