Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms