Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFHD1Q9BUP0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFHD1Q9BUP0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms