Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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