Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM175Q9BSA9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM175Q9BSA9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM175Q9BSA9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM175Q9BSA9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM175Q9BSA9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM175Q9BSA9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms