Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TUBA1CQ9BQE3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TUBA1CQ9BQE3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms