Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD5Q99666 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD5Q99666 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms