Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EYA1Q99502 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA1Q99502 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms