Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIN3AQ96ST3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms