Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARXQ96QS3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms