Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms