Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms