Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms