Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXB13Q92826 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms