Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms