Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPBP1Q92547 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms