Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf50Q8WW18 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms