Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBLCP1Q8WVY7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBLCP1Q8WVY7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBLCP1Q8WVY7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBLCP1Q8WVY7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBLCP1Q8WVY7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBLCP1Q8WVY7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms