Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms