Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN22Q8N7P3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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