Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIG3Q6UXM1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms