Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HES3Q5TGS1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HES3Q5TGS1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms