Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CEP170Q5SW79 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms