Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHYHD1Q5SRE7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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