Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSL3PQ5NE16 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms