Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM259Q4ZIN3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms