Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms